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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4fidB_ | PDB header: signaling protein | Chain: B: PDB Molecule: g protein alpha subunit; | PDBTitle: crystal structure of a heterotrimeric g-protein subunit from entamoeba2 histolytica, ehg-alpha-1 |
Added to library: Wed Jan 9 21:12:19 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | I | T | V | X | L | L | G | S | G | E | S | G | K | S | T | I | A | K | Q | L | K | I | L | F | G | G | G | F | P | E | Q | E | R | A | T | H | K | S | S | I | C | S | N | V | V | T | C | X | R | T | L | I | E | Q | S | A | I | L | N | H | P | X | K | Y | Q | P | K | S | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | G | G | G | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | F | T | T | E | D | P | V | T | L | P | F | S | P | E | L | V | G | D | V | E | A | L | W | A | D | E | G | I | Q | A | T | Y | E | E | S | A | K | F | Q | L | P | D | C | A | K | Y | L | F | E | N | V | K | R | I | A | X | E | D | Y | V | P | T | E | E | D | L | I | H | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | T | K | T | T | G | I | H | E | Y | D | F | V | V | K | D | I | P | F | H | L | I | D | V | G | V | S | F | F | S | D | V | D | C | A | I | F | V | T | S | L | A | E | Y | D | X | K | T | S | R | L | T | E | S | I | A | V | F | K | D | I | X | T | N | E | F | L | K | G | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | S | G | G | G | T | T | T | T | T | T | G | G | G | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | V | K | L | I | F | L | N | K | X | D | L | F | E | E | K | L | T | K | V | P | L | N | T | I | F | P | E | Y | T | G | G | D | N | A | V | X | G | A | Q | Y | I | Q | Q | L | F | T | G | K | L | Q | T | E | E | X | G | A | V | N | E | K | V | Y | T | N | P | T | N | A | T | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | T | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||
Sequence | G | S | N | I | K | R | V | F | X | L | A | V | D | V | I | X | K | N | X | A | A | N | G | K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S |
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