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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4etpA_ | PDB header: motor protein | Chain: A: PDB Molecule: kinesin-like protein kar3; | PDBTitle: c-terminal motor and motor homology domain of kar3vik1 fused to a2 synthetic heterodimeric coiled coil |
Added to library: Sat Jun 30 13:55:51 2012 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | I | A | A | L | K | E | K | I | A | A | L | K | E | K | I | A | A | L | K | E | K | I | K | D | T | E | L | G | M | K | E | L | N | E | I | L | I | K | E | E | T | V | R | R | T | L | H | N | E | L | Q | E | L | R | G | N | I | R | V | Y | L | R | I | R | P | A | L | K | N | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | N | S | D | T | S | L | I | N | V | N | E | F | D | D | N | S | G | V | Q | S | M | E | V | T | K | I | Q | N | T | A | Q | V | H | E | F | K | F | D | K | I | F | D | Q | Q | D | T | N | V | D | V | F | K | E | V | G | Q | L | V | Q | S | S | L | D | G | Y | N | V | A | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | B | T | T | T | T | B | S | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | F | A | Y | G | Q | T | G | S | G | K | T | F | T | M | L | N | P | G | D | G | I | I | P | S | T | I | S | H | I | F | N | W | I | N | K | L | K | T | K | G | W | D | Y | K | V | N | A | E | F | I | E | I | Y | N | E | N | I | V | D | L | L | R | S | S | I | G | L | K | H | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | T | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | I | R | H | D | Q | E | T | K | T | T | T | I | T | N | V | T | S | V | K | L | E | S | E | E | M | V | E | I | I | L | K | K | A | N | R | T | A | S | N | E | H | S | S | R | S | H | S | I | F | I | I | H | L | S | G | S | N | A | K | T | G | A | H | S | Y | G | T | L | N | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | V | D | L | A | G | S | E | R | I | N | V | S | Q | V | V | G | D | R | L | R | E | T | Q | N | I | N | K | S | L | S | A | L | G | D | V | I | H | A | L | G | Q | P | D | S | T | K | R | H | I | P | F | R | N | S | K | L | T | Y | L | L | Q | Y | S | L | T | G | D | S | K | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | S | S | T | T | T | S | G | G | G | S | T | G | G | G | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 370 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||
Sequence | L | M | F | V | N | I | S | P | S | S | S | H | I | N | E | T | L | N | S | L | R | F | A | S | K | V | N | S | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G |
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