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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4eozD_ | PDB header: protein binding | Chain: D: PDB Molecule: cullin-3; | PDBTitle: crystal structure of the spop btb domain complexed with the cul3 n-2 terminal domain |
Added to library: Sat Jun 2 12:08:42 2012 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | X | D | E | K | Y | V | N | S | I | W | D | L | L | K | N | A | I | Q | E | I | Q | R | K | N | N | S | G | L | S | F | E | E | L | Y | R | N | A | Y | T | X | V | L | H | K | H | G | E | K | L | Y | T | G | L | R | E | V | V | T | E | H | L | I | N | K | V | R | E | D | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | N | S | L | N | N | N | F | L | Q | T | L | N | Q | A | W | N | D | H | Q | T | A | X | V | X | I | R | D | I | L | X | Y | X | D | R | V | Y | V | Q | Q | N | N | V | E | N | V | Y | N | L | G | L | I | I | F | R | D | Q | V | V | R | Y | G | C | I | R | D | H | L | R | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | L | L | D | X | I | A | R | E | R | K | G | E | V | V | D | R | G | A | I | R | N | A | C | Q | X | L | X | I | L | G | L | E | G | R | S | V | Y | E | E | D | F | E | A | P | F | L | E | X | S | A | E | F | F | Q | X | E | S | Q | K | F | L | A | E | N | S | A | S | V | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | I | K | K | V | E | A | R | I | N | E | E | I | E | R | V | X | H | C | L | D | K | S | T | E | E | P | I | V | K | V | V | E | R | E | L | I | S | K | H | X | K | T | I | V | E | X | E | N | S | G | L | V | H | X | L | K | N | G | K | T | E | D | L | G | C | X | Y | K | L | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | G | G | G | T | G | G | G | T | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | S | R | V | P | N | G | L | K | T | X | C | E | C | X | S | S | Y | L | R | E | Q | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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