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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4ei0B_ | PDB header: structural genomics, unknown function | Chain: B: PDB Molecule: uncharacterized hypothetical protein; | PDBTitle: crystal structure of a hypothetical protein (parmer_03218) from2 parabacteroides merdae atcc 43184 at 2.00 a resolution |
Added to library: Sat Jun 2 12:14:56 2012 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | P | V | S | A | L | S | N | D | C | I | K | R | S | L | P | V | A | P | N | I | V | G | N | E | I | E | F | A | Y | A | X | A | I | P | N | E | L | G | K | L | S | S | A | Q | V | V | S | S | I | A | G | A | T | G | T | Y | F | D | P | N | S | Y | Y | T | N | S | S | G | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | B | T | T | S | T | T | T | S | S | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | I | P | V | K | V | C | S | D | S | Q | T | N | G | T | T | T | V | I | D | F | T | V | D | T | C | A | A | T | L | R | Y | Y | Y | I | I | P | E | E | A | R | G | K | D | V | Q | F | S | F | S | V | K | A | S | N | G | Q | V | A | E | Y | K | L | G | P | Y | K | I | S | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | B | S | S | G | G | G | T | T | S | T | T | S | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | X | D | X | A | K | N | L | S | V | T | N | D | K | C | Y | L | S | F | L | N | E | G | E | A | V | H | I | Y | S | K | A | D | L | Q | A | N | P | S | L | A | A | K | I | D | I | X | Y | A | Y | S | E | K | S | D | L | S | H | A | F | Y | T | S | S | S | P | K | E | Y | X | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | S | G | G | G | G | G | G | S | S | T | T | T | S | T | T | G | G | G | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | G | T | E | L | P | S | G | F | V | N | N | T | K | X | I | K | V | Y | G | L | Q | D | R | Q | L | S | D | L | Q | Y | S | K | F | I | D | D | L | D | F | E | T | I | D | X | S | K | C | T | N | Y | I | L | G | L | K | E | E | A | G | A | W | V | E | T | A | D | G | K | Y | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | B | S | S | B | T | T | B | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | Y | V | Y | I | N | K | A | S | A | S | E | V | T | V | S | V | K | R | Y | K | X | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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