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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4ea3A_ | PDB header: signaling protein | Chain: A: PDB Molecule: fusion protein of nociceptin receptor and cytochrome b562; | PDBTitle: structure of the n/ofq opioid receptor in complex with a peptide2 mimetic |
Added to library: Sat Apr 28 14:12:36 2012 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | L | G | L | K | V | T | I | V | G | L | Y | L | A | V | C | V | G | G | L | L | G | N | C | L | V | M | Y | V | I | L | R | H | T | K | M | K | T | A | T | N | I | Y | I | F | N | L | A | L | A | D | T | L | V | L | L | T | L | P | F | Q | G | T | D | I | L | L | G | F | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | F | G | N | A | L | C | K | T | V | I | A | I | D | Y | Y | N | M | F | T | S | T | F | T | L | T | A | M | S | V | D | R | Y | V | A | I | C | H | P | T | S | S | K | A | Q | A | V | N | V | A | I | W | A | L | A | S | V | V | G | V | P | V | A | I | M | G | S | A | Q | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | D | E | E | I | E | C | L | V | E | I | P | T | P | Q | D | Y | W | G | P | V | F | A | I | C | I | F | L | F | S | F | I | V | P | V | L | V | I | S | V | C | Y | S | L | M | I | R | R | L | R | G | V | R | L | L | S | G | S | R | E | K | D | R | N | L | R | R | I | T | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | L | V | L | V | V | V | A | V | F | V | G | C | W | T | P | V | Q | V | F | V | L | A | Q | G | L | G | V | Q | P | S | S | E | T | A | V | A | I | L | R | F | C | T | A | L | G | Y | V | N | S | C | L | N | P | I | L | Y | A | F | L | D | E | N | F | K | A | C | F | R | ||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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