|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c4e9jB_ | PDB header: protein transport | Chain: B: PDB Molecule: general secretion pathway protein d; | PDBTitle: crystal structure of the n-terminal domain of the secretin xcpq from2 pseudomonas aeruginosa |
Added to library: Wed Jan 9 19:31:27 2013 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | A | H | W | T | I | N | L | K | D | A | D | I | R | E | F | I | D | Q | I | S | E | I | T | G | E | T | F | V | V | D | P | R | V | K | G | Q | V | S | V | V | S | K | A | Q | L | S | L | S | E | V | Y | Q | L | F | L | S | V | M | S | T | H | G | F | T | V | V | A | Q | G | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | A | R | I | V | P | N | R | L | E | T | R | V | I | Q | V | Q | Q | S | P | V | S | E | L | I | P | L | I | R | P | L | V | P | Q | Y | G | H | L | A | A | V | P | S | A | N | A | L | I | I | S | D | R | S | A | N | I | A | R | I | E | D | V | I | R | Q | L | D | Q | K | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | G | G | G | S | T | T | S | G | G | G | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | S | H | D | Y | S | V | I | N | L | R | Y | G | W | V | M | D | A | A | E | V | L | N | N | A | M | S | R | G | Q | A | K | G | A | A | G | A | Q | V | I | A | D | A | R | T | N | R | L | I | I | L | G | P | P | Q | A | R | A | K | L | V | Q | L | A | Q | S | L | D | T | ||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|