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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4e5vA_ | PDB header: structural genomics, unknown function | Chain: A: PDB Molecule: putative thua-like protein; | PDBTitle: crystal structure of a putative thua-like protein (parmer_02418) from2 parabacteroides merdae atcc 43184 at 1.75 a resolution |
Added to library: Sat Apr 7 17:49:17 2012 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | R | K | P | I | K | T | L | L | I | T | G | Q | N | N | H | N | W | Q | V | S | H | V | V | L | K | Q | I | L | E | N | S | G | R | F | D | V | D | F | V | I | S | P | E | Q | G | K | D | X | S | G | F | V | L | D | F | S | P | Y | Q | L | V | V | L | D | Y | N | G | D | S | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | E | E | T | N | R | R | F | L | E | Y | V | Q | N | G | G | G | V | V | I | Y | H | A | A | D | N | A | F | S | K | W | P | E | F | N | R | I | C | A | L | G | G | W | E | G | R | N | E | N | S | G | P | Y | V | Y | W | K | D | G | K | L | V | K | D | S | S | A | G | P | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | G | G | S | T | T | S | B | T | T | S | G | G | G | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | S | H | G | R | Q | H | E | Y | V | L | N | G | R | D | K | V | H | P | V | V | K | G | L | P | L | K | W | R | H | A | K | D | E | L | Y | D | R | X | R | G | P | G | N | I | R | D | I | L | Y | T | A | Y | S | D | K | E | T | N | G | S | G | R | E | E | P | L | V | F | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | S | S | B | S | B | S | G | G | G | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | V | D | Y | G | N | A | R | I | F | H | T | X | L | G | H | A | G | A | T | T | E | D | N | I | A | X | Q | C | T | G | F | Q | V | L | L | L | R | G | A | E | W | A | A | T | G | K | V | T | Q | K | V | P | K | D | F | P | T | E | T | T | C | S | Y | R | K | D | Y | K | E | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | S | S | B | S | T | T | S | S | B | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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