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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4dkdC_ | PDB header: cytokine/transferase | Chain: C: PDB Molecule: macrophage colony-stimulating factor 1 receptor; | PDBTitle: crystal structure of human interleukin-34 bound to human csf-1r |
Added to library: Sat Apr 14 14:07:22 2012 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | I | P | V | I | E | P | S | V | P | E | L | V | V | K | P | G | A | T | V | T | L | R | C | V | G | N | G | S | V | E | W | D | G | P | P | S | P | H | W | T | L | Y | S | D | G | S | S | S | I | L | S | T | N | N | A | T | F | Q | N | T | G | T | Y | R | C | T | E | P | G | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | B | S | S | B | T | T | S | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | A | A | I | H | L | Y | V | K | D | P | A | R | P | W | N | V | L | A | Q | E | V | V | V | F | E | D | Q | D | A | L | L | P | C | L | L | T | D | P | V | L | E | A | G | V | S | L | V | R | V | R | G | R | P | L | M | R | H | T | N | Y | S | F | S | P | W | H | G | F | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | S | S | S | G | G | G | G | S | S | G | G | G | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | H | R | A | K | F | I | Q | S | Q | D | Y | Q | C | S | A | L | M | G | G | R | K | V | M | S | I | S | I | R | L | K | V | Q | K | V | I | P | G | P | P | A | L | T | L | V | P | A | E | L | V | R | I | R | G | E | A | A | Q | I | V | C | S | A | S | S | V | D | V | N | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | S | T | T | S | S | S | S | S | B | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . |
Sequence | D | V | F | L | Q | H | N | N | T | K | L | A | I | P | Q | Q | S | D | F | H | N | N | R | Y | Q | K | V | L | T | L | N | L | D | Q | V | D | F | Q | H | A | G | N | Y | S | C | V | A | S | N | V | Q | G | K | H | S | T | S | M | F | F | R | V | ||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | T | T | S | S | T | T | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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