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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4dk1B_ | PDB header: membrane protein | Chain: B: PDB Molecule: putative maca, multidrug resistance protein mexa; | PDBTitle: crystal structure of maca-mexa chimeric protein, containing the2 pseudomonas aeruginosa mexa alpha-hairpin domain. |
Added to library: Sat Mar 10 13:19:52 2012 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | E | E | V | K | R | G | N | I | E | K | N | V | V | A | T | G | S | I | E | S | I | N | T | V | D | V | G | A | Q | V | S | G | K | I | T | K | L | Y | V | K | L | G | Q | Q | V | K | K | G | D | L | L | A | E | I | D | P | A | T | Y | E | A | D | Y | Q | S | A | Q | A | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | S | S | S | B | S | S | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | A | S | T | Q | E | Q | A | Q | R | Y | K | L | L | V | A | D | Q | A | V | S | K | Q | Q | Y | A | D | A | N | A | A | Y | L | Q | S | K | A | A | V | E | Q | A | R | I | N | L | R | Y | T | K | I | T | S | P | I | D | G | T | V | I | S | T | P | V | S | E | G | Q | T | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | S | N | Q | T | T | P | T | I | I | K | V | A | D | L | S | K | X | R | I | K | P | E | I | S | E | G | D | I | T | K | V | K | A | G | Q | D | V | T | F | T | I | L | S | D | N | K | T | V | Y | H | A | K | I | D | S | V | D | P | A | T | T | T | I | S | D | A | V | Y | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | B | T | T | G | G | G | S | S | S | S | S | S | S | S | B | T | T | T | B | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | Y | A | N | I | I | V | E | N | P | E | H | V | L | R | I | G | X | T | T | E | N | N | I | K | I | A | D | V | Q | N | V | L | F | I | P | N | L | A | V | Q | Q | D | K | Y | V | V | E | R | E | I | E | I | G | V | Q | N | D | F | Q | T | E | V | K | S | G | L | T | E | G | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | B | B | S | S | S | S | B | S | S | S |   | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | K | V | V | I | S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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