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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4dhjL_ | PDB header: hydrolase/signaling protein/ligase | Chain: L: PDB Molecule: ubiquitin thioesterase otubain-like; | PDBTitle: the structure of a ceotub1 ubiquitin aldehyde ubc13~ub complex |
Added to library: Sat Feb 25 11:39:49 2012 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Q | K | S | V | P | L | V | A | T | L | A | P | F | S | I | L | C | A | E | Y | D | N | E | T | S | A | A | F | L | S | K | A | T | E | L | S | E | V | Y | G | E | I | R | Y | I | R | G | D | G | N | C | F | Y | R | A | I | L | V | G | L | I | E | I | M | L | K | D | R | A | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | T | T | T | T | T | T | T | T | B | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | E | K | F | I | A | S | S | R | D | W | T | R | T | L | V | E | L | G | F | P | D | W | T | C | T | D | F | C | D | F | F | I | E | F | L | E | K | I | H | S | G | V | H | T | E | E | A | V | Y | T | I | L | N | D | D | G | S | A | N | Y | I | L | M | F | F | R | L | I | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | A | F | L | K | Q | N | S | E | E | Y | A | P | F | I | D | E | G | M | T | V | A | Q | Y | C | E | Q | E | I | E | P | M | W | K | D | A | D | H | L | A | I | N | S | L | I | K | A | A | G | T | R | V | R | I | E | Y | M | D | R | T | A | A | P | N | G | G | W | H | Y | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | T | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||
Sequence | I | P | S | D | D | Q | Q | I | A | P | E | I | T | L | L | Y | R | P | G | H | Y | D | V | I | Y | K | K | D | S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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