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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4depF_ | PDB header: immune system | Chain: F: PDB Molecule: interleukin-1 receptor accessory protein; | PDBTitle: structure of the il-1b signaling complex |
Added to library: Wed Jan 9 20:00:03 2013 | |
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Sequence | D | D | W | G | L | D | T | M | R | Q | I | Q | V | F | E | D | E | P | A | R | I | K | C | P | L | F | E | H | F | L | K | F | N | Y | S | T | A | H | S | A | G | L | T | L | I | W | Y | W | T | R | D | L | E | E | L | P | E | N | R | I | S | K | E | K | D | V | L | W | F | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | B | T | T | T | B | S | S | S | T | T | S | T | T | B | B | T | T | S | B | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | T | L | L | N | D | T | G | N | Y | T | C | M | L | R | N | T | T | Y | C | S | K | V | A | F | P | L | E | V | V | Q | K | D | S | C | F | N | S | P | M | K | L | P | V | H | K | L | Y | I | E | Y | G | I | Q | R | I | T | C | P | N | V | D | G | Y | F | P | S | S | V | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | S | S | T | T | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | P | T | I | T | W | Y | M | G | C | Y | K | I | Q | N | F | N | N | V | I | P | E | G | M | N | L | S | F | L | I | A | L | I | S | N | N | G | N | Y | T | C | V | V | T | Y | P | G | R | T | F | H | L | T | R | T | L | T | V | K | V | V | G | S | P | K | N | A | V | P | P | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | T | T | S | G | G | G | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | I | H | S | P | N | D | H | V | V | Y | E | L | I | P | C | T | V | Y | F | S | F | L | M | D | S | R | N | E | V | W | W | T | I | D | T | I | N | E | S | I | S | H | S | R | T | E | D | E | T | R | T | Q | I | L | S | D | L | K | R | S | Y | V | C | H | A | R | S | A | K | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | B | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | E | V | A | K | A | A | K | V | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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