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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4d5tC_ | PDB header: viral protein | Chain: C: PDB Molecule: protein a49r; | PDBTitle: structure of n-terminally truncated a49 from vaccinia virus2 western reserve |
Added to library: Sat Jan 24 08:14:40 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | L | G | Y | V | S | D | M | H | T | E | L | A | S | I | S | Q | L | V | I | A | K | I | E | T | I | D | N | D | I | L | N | K | D | I | V | N | F | I | M | C | R | S | N | L | D | N | P | F | I | S | F | L | D | T | V | Y | T | I | I | D | Q | E | N | Y | Q | T | E | L | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | G | G | G | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | S | L | D | D | N | E | I | I | D | C | I | V | N | K | F | M | S | F | Y | K | D | N | L | E | N | I | V | D | A | I | I | T | L | K | Y | I | M | N | N | P | D | F | K | T | T | Y | A | E | V | L | G | S | R | I | A | D | I | D | I | K | Q | V | I | R | E | N | I | L | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | G | S | S | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | S | N | D | I | R | E | R | Y | L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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