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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4d51A_ | PDB header: structural protein | Chain: A: PDB Molecule: cyma; | PDBTitle: crystal structure of cyma from klebsiella oxytoca |
Added to library: Sat Jun 6 08:36:21 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | S | D | Q | R | G | Y | K | P | G | G | H | V | G | T | S | V | E | Y | E | D | K | V | T | R | G | F | N | N | T | D | K | K | E | K | T | I | T | N | E | V | F | N | F | F | Y | N | N | P | Q | W | N | F | M | G | F | Y | S | F | K | I | E | N | R | E | Q | K | E | P | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | Y | E | N | E | D | G | I | K | Q | L | F | S | L | N | K | G | H | D | L | G | N | G | W | A | T | G | L | I | Y | E | L | E | Y | T | R | S | K | V | Y | S | P | D | V | S | G | L | R | K | N | L | A | E | H | S | I | R | P | Y | L | T | Y | W | N | N | D | Y | N | M | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | F | Y | S | N | L | E | Y | L | L | S | K | E | D | R | N | A | W | G | K | R | Q | E | Q | G | Y | S | A | L | F | K | P | Y | K | R | F | G | N | W | E | V | G | V | E | F | Y | Y | Q | I | K | T | N | D | E | K | Q | P | D | G | T | I | N | E | K | S | D | F | N | E | R | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | I | E | P | I | V | Q | Y | S | F | D | D | A | G | T | L | Y | T | R | V | R | V | G | K | N | E | T | K | N | T | D | R | S | G | G | G | N | A | G | I | N | Y | F | K | D | I | R | K | A | T | V | G | Y | E | Q | S | I | G | E | S | W | V | A | K | A | E | Y | E | Y | A | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | ||||||||||||||||||||||||
Sequence | E | V | E | K | K | S | R | L | S | G | W | E | A | R | N | K | S | E | L | T | Q | H | T | F | Y | A | Q | A | L | Y | R | F | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S |
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