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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4d18F_ | PDB header: signaling protein | Chain: F: PDB Molecule: cop9 signalosome complex subunit 6; | PDBTitle: crystal structure of the cop9 signalosome |
Added to library: Sat Jul 26 08:18:59 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | V | M | A | C | G | V | T | G | S | V | S | V | A | L | H | P | L | V | I | L | N | I | S | D | H | W | I | R | M | R | S | Q | E | G | R | P | V | Q | V | I | G | A | L | I | G | K | Q | E | G | R | N | I | E | V | M | N | S | F | E | L | L | S | H | T | V | E | E | K | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | I | D | K | E | Y | Y | Y | T | K | E | E | Q | F | K | Q | V | F | K | E | L | E | F | L | G | W | Y | T | T | G | G | P | P | D | P | S | D | I | H | V | H | K | Q | V | C | E | I | I | E | S | P | L | F | L | K | L | N | P | M | T | K | H | T | D | L | P | V | S | V | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | S | V | I | D | I | I | N | G | E | A | T | M | L | F | A | E | L | T | Y | T | L | A | T | E | E | A | E | R | I | G | V | D | H | V | A | R | M | T | S | T | V | A | E | H | L | I | A | Q | H | S | A | I | K | M | L | H | S | R | V | K | L | I | L | E | Y | V | K | A | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | E | A | G | E | V | P | F | N | H | E | I | L | R | E | A | Y | A | L | C | H | C | L | P | V | L | S | T | D | K | F | K | T | D | F | Y | D | Q | C | N | D | V | G | L | M | A | Y | L | G | T | I | T | K | T | C | N | T | M | N | Q | F | V | N | K | F | N | V | L | Y | D | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | T | S |   | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | Q | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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