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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4d0kA_ | PDB header: gene regulation | Chain: A: PDB Molecule: a-specific ribonuclease subunit pan2; | PDBTitle: complex of chaetomium thermophilum pan2 (wd40-cs1) with pan3 (c-term) |
Added to library: Sat Jun 7 08:37:41 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | D | A | D | W | D | E | V | T | R | I | A | Y | P | A | P | G | T | F | P | R | P | A | T | A | V | A | F | D | P | I | A | E | L | L | W | A | G | F | D | R | G | R | V | C | S | F | Y | G | R | D | L | T | R | Y | T | A | F | K | I | Q | P | A | S | E | G | P | V | R | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G | T | T | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | L | F | H | D | K | G | V | I | V | L | G | T | R | S | V | H | M | A | M | R | R | G | P | A | L | W | N | I | R | H | E | N | M | K | D | L | R | C | M | S | F | T | S | K | G | T | Q | E | I | I | V | A | G | W | Q | D | T | M | L | V | I | D | V | L | K | G | D | I | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | Q | I | P | A | Q | H | H | Y | S | I | M | K | K | S | R | Y | I | C | A | A | T | K | T | G | S | V | D | L | I | D | P | L | S | F | K | I | V | R | S | W | Q | A | H | A | S | Y | I | N | D | M | D | A | Q | N | D | F | I | V | T | C | G | G | S | Y | M | L | D | P | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | T | S | S | S | T | T | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | V | N | V | F | D | L | K | N | M | A | S | M | K | P | M | P | F | P | P | L | A | A | H | V | R | L | H | P | R | M | L | T | T | A | I | V | T | S | Q | H | G | Q | M | H | V | V | D | I | M | N | P | N | S | S | T | V | R | Y | A | N | I | S | S | Y | V | K | L | F | E | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||
Sequence | A | P | S | G | E | A | L | V | I | G | D | A | D | C | N | I | H | L | W | G | S | P | T | K | I | H | F | T | D | M | A | I | P | I | E | L | P | E | P | V | L | D | W | S | E | T | P | L | S | |||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T | S | S | S | S |
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