|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c4cr4U_ | PDB header: hydrolase | Chain: U: PDB Molecule: 26s proteasome regulatory subunit rpn8; | PDBTitle: deep classification of a large cryo-em dataset defines the2 conformational landscape of the 26s proteasome |
Added to library: Sat Apr 5 08:18:02 2014 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | H | E | K | V | T | I | A | P | L | V | L | L | S | A | L | D | H | Y | E | R | T | Q | T | K | E | N | K | R | C | V | G | V | I | L | G | D | A | N | S | S | T | I | R | V | T | N | S | F | A | L | P | F | E | E | D | E | K | N | S | D | V | W | F | L | D | H | N | Y | I | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | M | N | E | M | C | K | K | I | N | A | K | E | K | L | I | G | W | Y | H | S | G | P | K | L | R | A | S | D | L | K | I | N | E | L | F | K | K | Y | T | Q | N | N | P | L | L | L | I | V | D | V | K | Q | Q | G | V | G | L | P | T | D | A | Y | V | A | I | E | Q | E | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | F | L | H | L | P | C | T | I | E | A | E | E | A | E | E | I | G | V | E | H | L | L | R | I | R | L | T | N | Q | L | K | S | L | K | G | L | Q | S | K | L | K | D | V | V | E | Y | L | D | K | V | I | H | T | I | L | G | K | L | Q | D | V | F | N | L | N | N | L | Q | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | B | B | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||
Sequence | A | L | T | V | K | T | N | D | E | L | M | V | I | Y | I | S | N | L | V | R | S | I | I | A | F | D | D | L | I | E | N | K | I | Q | N | K | K | I | Q | E | Q | R | V | K | D | |||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|