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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4cr2T_ | PDB header: hydrolase | Chain: T: PDB Molecule: 26s proteasome regulatory subunit rpn12; | PDBTitle: deep classification of a large cryo-em dataset defines the2 conformational landscape of the 26s proteasome |
Added to library: Sat Apr 5 08:19:15 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | P | S | L | A | E | L | T | K | S | L | S | I | A | F | E | N | G | D | Y | A | A | C | E | K | L | L | P | P | I | K | I | E | L | I | K | N | N | L | L | I | P | D | L | S | I | Q | N | D | I | Y | L | N | D | L | M | I | T | K | R | I | L | E | V | G | A | L | A | S | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | T | F | N | F | D | S | F | E | N | Y | F | N | Q | L | K | P | Y | Y | F | S | N | N | H | K | L | S | E | S | D | K | K | S | K | L | I | S | L | Y | L | L | N | L | L | S | Q | N | N | T | T | K | F | H | S | E | L | Q | Y | L | D | K | H | I | K | N | L | E | D | D | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | L | S | Y | P | I | K | L | D | R | W | L | M | E | G | S | Y | Q | K | A | W | D | L | L | Q | S | G | S | Q | N | I | S | E | F | D | S | F | T | D | I | L | K | S | A | I | R | D | E | I | A | K | N | T | E | L | S | Y | D | F | L | P | L | S | N | I | K | A | L | L | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . |
Sequence | F | N | N | E | K | E | T | E | K | F | A | L | E | R | N | W | P | I | V | N | S | K | V | Y | F | N | N | Q | S | K | E | K | A | D | Y | E | D | E | M | M | H | E | E | D | Q | K | T | N | I | I | E | K | A | M | D | Y | A | I | S | I | E | N | ||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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