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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4cr2R_ | PDB header: hydrolase | Chain: R: PDB Molecule: 26s proteasome regulatory subunit rpn7; | PDBTitle: deep classification of a large cryo-em dataset defines the2 conformational landscape of the 26s proteasome |
Added to library: Sat Apr 5 08:18:07 2014 | |
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Sequence | N | Y | E | V | S | E | K | A | F | L | L | T | Q | S | K | V | S | I | E | Q | R | K | E | A | A | E | F | V | L | A | K | I | K | E | E | E | M | A | P | Y | Y | K | Y | L | C | E | E | Y | L | V | N | N | G | Q | S | D | L | E | H | D | E | K | S | D | S | L | N | E | W | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | T | S | S | S | S | S | B | S | S | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | F | D | Q | E | L | Y | N | E | L | C | K | K | N | E | S | K | I | K | E | L | N | E | K | I | Q | K | L | E | E | D | D | E | G | E | L | E | Q | A | Q | A | W | I | N | L | G | E | Y | Y | A | Q | I | G | D | K | D | N | A | E | K | T | L | G | K | S | L | S | K | A | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | T | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | T | G | A | K | I | D | V | M | L | T | I | A | R | L | G | F | F | Y | N | D | Q | L | Y | V | K | E | K | L | E | A | V | N | S | M | I | E | K | G | G | D | W | E | R | R | N | R | Y | K | T | Y | Y | G | I | H | C | L | A | V | R | N | F | K | E | A | A | K | L | L | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | D | S | L | A | T | F | T | S | I | E | L | T | S | Y | E | S | I | A | T | Y | A | S | V | T | G | L | F | T | L | E | R | T | D | L | K | S | K | V | I | D | S | P | E | L | L | S | L | I | S | T | T | A | A | L | Q | S | I | S | S | L | T | I | S | L | Y | A | S | D | Y | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | S | Y | F | P | Y | L | L | E | T | Y | A | N | V | L | I | P | C | K | Y | L | N | R | H | A | D | F | F | V | R | E | M | R | R | K | V | Y | A | Q | L | L | E | S | Y | K | T | L | S | L | K | S | M | A | S | A | F | G | V | S | V | A | F | L | D | N | D | L | G | K | F | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | S | S | S | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 370 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 380 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 390 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 400 |
Sequence | P | N | K | Q | L | N | C | V | I | D | R | V | N | G | I | V | E | T | N | R | P | D | N | K | N | A | Q | Y | H | L | L | V | K | Q | G | D | G | L | L | T | K | L | Q | K | Y | G | A | A | V | R | ||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | T | S | T | T | T | T | S |
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