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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4cnlA_ | PDB header: choline-binding protein | Chain: A: PDB Molecule: putative pneumococcal surface protein; | PDBTitle: crystal structure of the choline-binding domain of cbpl2 from streptococcus pneumoniae |
Added to library: Sat Feb 21 08:15:24 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | T | S | G | W | V | K | Q | D | G | A | W | Y | Y | F | D | G | N | G | N | L | V | K | N | A | W | Q | G | S | Y | Y | L | K | A | D | G | K | M | A | Q | S | E | W | I | Y | D | S | S | Y | Q | A | W | Y | Y | L | K | S | D | G | S | Y | A | K | N | A | W | Q | G | A | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | B | S | T | T | T | T | S | B | S | T | T | T | T | T | T | S | B | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | L | K | S | N | G | K | M | A | Q | G | E | W | V | Y | D | S | S | Y | Q | A | W | Y | Y | L | K | S | D | G | S | Y | A | R | N | A | W | Q | G | N | Y | Y | L | K | S | D | G | K | M | A | K | G | E | W | V | Y | D | A | T | Y | Q | A | W | Y | Y | L | T | S | D | G | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | B | S | T | T | T | T | T | T | S | B | S | T | T | T | T | S | B | S | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . |
Sequence | Y | A | Y | S | T | W | Q | G | N | Y | Y | L | K | S | D | G | K | M | A | V | N | E | W | V | D | G | G | R | Y | Y | V | G | A | D | G | V | W | K | E | V | Q | A | ||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | T | T | T | T | S | B | S | T | T | T | T | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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