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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4clcD_ | PDB header: protein transport | Chain: D: PDB Molecule: upf0303 protein ybr137w; | PDBTitle: crystal structure of ybr137w protein |
Added to library: Sat Nov 22 08:14:00 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | V | V | L | D | K | K | L | L | E | R | L | T | S | R | K | V | P | L | E | Q | L | E | D | M | E | K | R | C | F | L | S | T | F | T | Y | Q | D | A | F | D | L | G | T | Y | I | R | N | A | V | K | E | N | F | P | E | K | P | V | A | I | D | I | S | L | P | N | G | H | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | F | R | T | V | T | Y | G | G | S | A | L | D | N | D | F | W | I | Q | R | K | K | K | T | A | L | R | F | G | H | S | S | F | Y | M | G | C | K | K | G | D | K | T | P | E | E | K | F | F | V | D | S | K | E | Y | A | F | H | G | G | A | V | L | I | Q | S | E | R | S | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | S | T | S | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | ||||||||||||||||
Sequence | Y | P | Y | A | C | L | T | I | S | G | L | K | Q | E | E | D | H | L | M | A | V | S | S | L | I | A | F | A | N | E | S | L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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