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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4cjyD_ | PDB header: transferase | Chain: D: PDB Molecule: cyclin-dependent kinase 12; | PDBTitle: crystal structure of the human cdk12-cyclink complex |
Added to library: Sat Jan 18 09:59:20 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | C | V | D | K | F | D | I | I | G | I | I | G | E | G | T | Y | G | Q | V | Y | K | A | K | D | K | D | T | G | E | L | V | A | L | K | K | V | R | L | K | E | G | F | P | I | T | A | I | R | E | I | K | I | L | R | Q | L | I | H | R | S | V | V | N | M | K | E | I | V | T | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | F | Y | L | V | F | E | Y | M | D | H | D | L | M | G | L | L | H | F | S | E | D | H | I | K | S | F | M | K | Q | L | M | E | G | L | E | Y | C | H | K | K | N | F | L | H | R | D | I | K | C | S | N | I | L | L | N | N | S | G | Q | I | K | L | A | D | F | G | L | A | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | - | T | T | S | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | Y | N | P | Y | N | K | V | I | T | L | W | Y | R | P | P | E | L | L | L | G | E | E | R | Y | T | P | A | I | D | V | W | S | C | G | C | I | L | G | E | L | F | T | K | K | P | I | F | Q | A | N | L | E | L | A | Q | L | E | L | I | S | R | L | C | G | S | P | C | P | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | T | T | G | G | G | T | S | T | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . |
Sequence | V | W | P | D | V | I | K | L | P | Y | F | N | T | M | K | P | K | K | Q | Y | R | R | R | L | R | E | E | F | S | F | I | P | S | A | A | L | D | L | L | D | H | M | L | T | L | D | P | S | K | R | C | T | A | E | Q | T | L | Q | S | D | F | L | ||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | G | G | S | T | T | S | T | T | S | S | S | T | S | S | T | S | S | T | T | S | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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