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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4cijA_ | PDB header: isomerase | Chain: A: PDB Molecule: gst rep; | PDBTitle: structure of rolling circle replication initiator protein2 from geobacillus stearothermophilus. |
Added to library: Sat Dec 27 08:28:37 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | S | G | L | K | P | C | V | D | W | L | Q | V | T | F | K | T | G | Q | D | S | V | K | K | C | V | E | K | L | E | K | V | F | E | I | L | G | L | N | E | A | E | F | L | P | L | K | N | G | K | Y | G | Y | K | Q | G | V | A | F | Q | G | N | P | V | L | A | V | Y | Y | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | B | T | T | G | G | G | S | B | T | T | B | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | A | D | D | M | G | I | H | V | E | M | T | G | Q | G | C | R | L | F | E | L | H | T | S | I | N | W | Y | E | L | F | Y | R | L | V | Y | E | Y | E | V | N | I | T | R | L | D | V | A | V | D | D | F | K | G | Y | F | K | I | N | T | L | V | K | K | L | K | D | D | E | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | T | B | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | S | R | F | K | K | A | R | H | I | E | N | I | V | I | E | G | G | E | T | I | G | H | T | L | Y | F | G | A | P | S | S | D | I | Q | V | R | F | Y | E | K | N | V | Q | M | G | M | D | I | D | V | W | N | R | T | E | I | Q | L | R | D | D | R | A | H | V | V | A | Q | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | S | T | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | I | A | D | D | V | L | P | L | G | E | I | V | A | G | L | L | R | N | Y | I | Q | F | R | T | R | K | A | T | D | K | N | K | K | R | W | P | L | A | R | F | W | L | N | F | L | G | D | V | Q | P | L | R | I | A | K | Q | M | |||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | B | T | T | S | G | G | G | S | B | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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