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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4ch7A_ | PDB header: transcription | Chain: A: PDB Molecule: nird-like protein; | PDBTitle: crystal structure of the siroheme decarboxylase nirdl |
Added to library: Sat Aug 2 08:23:47 2014 | |
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Sequence | N | E | F | D | K | I | L | K | I | I | Q | K | D | I | P | L | V | K | E | P | F | S | V | L | A | Q | E | V | G | I | E | E | G | K | L | L | K | T | I | E | K | L | V | E | D | G | I | V | R | H | I | A | P | I | Y | D | S | R | L | L | G | Y | D | S | A | L | I | A | F | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | S | T | S | S | T | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | D | R | Q | K | L | E | E | V | A | N | F | V | N | A | C | P | G | V | S | H | N | Y | E | R | T | H | D | F | N | L | W | F | T | L | A | V | P | P | E | I | S | E | L | E | D | V | V | R | L | X | A | E | R | E | R | V | K | D | Y | L | V | L | R | V | V | R | L | F | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | Y | T | Y | T | P | L | T | E | E | E | K | R | I | V | S | I | T | Q | G | S | F | P | L | V | E | R | P | F | L | E | Y | A | K | R | L | R | X | S | E | E | E | L | L | E | K | L | S | A | L | K | E | R | G | V | L | R | R | I | S | A | V | Y | V | A | N | A | X | S | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | W | E | V | P | E | D | A | I | E | E | V | G | R | Y | I | A | G | F | K | G | V | S | H | C | Y | Q | R | T | T | S | E | K | F | R | Y | N | L | F | A | X | X | H | G | K | G | Q | E | E | I | K | L | L | A | E | T | I | S | R | E | K | A | L | S | K | Y | A | L | L | F | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||
Sequence | T | R | E | F | K | K | V | R | I | K | Y | F | S | E | E | F | E | R | W | F | K | E | L | I | S | A | L | E | H | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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