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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4cd9B_ | PDB header: cell adhesion | Chain: B: PDB Molecule: surface protein g; | PDBTitle: structure of sasg a-domain (residues 163-419) from staphylococcus2 aureus |
Added to library: Sat Nov 15 08:12:30 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | P | I | T | I | Q | G | K | E | H | F | E | G | Y | G | S | V | D | I | Q | K | K | P | T | D | L | G | V | S | E | V | T | R | F | N | V | G | N | E | S | N | G | L | I | G | A | L | Q | L | K | N | K | I | D | F | S | K | D | F | N | F | K | V | R | V | A | N | N | H | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | N | T | T | G | A | D | G | W | G | F | L | F | S | K | G | N | A | E | E | Y | L | T | N | G | G | I | L | G | D | K | G | L | V | N | S | G | G | F | K | I | D | T | G | Y | I | Y | T | S | S | M | D | K | T | E | K | Q | A | G | Q | G | Y | R | G | Y | G | A | F | V | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | B | S | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | D | S | S | G | N | S | Q | M | V | G | E | N | I | D | S | K | T | N | F | L | N | Y | A | D | N | S | T | N | T | S | D | G | K | F | H | G | Q | R | L | N | D | V | I | L | T | Y | V | A | S | T | G | K | M | R | A | E | Y | A | G | K | T | W | E | T | S | I | T | D | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | G | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | |
Sequence | G | L | S | K | N | Q | A | Y | N | F | L | I | T | S | S | Q | R | W | G | L | N | Q | G | I | N | A | N | G | W | M | R | T | D | L | K | G | S | E | F | T | F | T | P | E | A | |||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | S | S | S | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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