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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4cciA_ | PDB header: sugar binding protein | Chain: A: PDB Molecule: accumulation associated protein; | PDBTitle: structure of aap a-domain (residues 351-605) from2 staphylococcus epidermidis |
Added to library: Sat Nov 8 08:31:09 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | I | P | P | T | T | V | K | G | R | D | N | Y | D | F | Y | G | R | V | D | I | E | S | N | P | T | D | L | N | A | T | N | L | T | R | Y | N | Y | G | Q | P | P | G | T | T | T | A | G | A | V | Q | F | K | N | Q | V | S | F | D | K | D | F | D | F | N | I | R | V | A | N | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | B | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | Q | S | N | T | T | G | A | D | G | W | G | F | M | F | S | K | K | D | G | D | D | F | L | K | N | G | G | I | L | R | E | K | G | T | P | S | A | A | G | F | R | I | D | T | G | Y | Y | N | N | D | P | L | D | K | I | Q | K | Q | A | G | Q | G | Y | R | G | Y | G | T | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | B | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | K | N | D | S | Q | G | N | T | S | K | V | G | S | G | T | P | S | T | D | F | L | N | Y | A | D | N | T | T | N | D | L | D | G | K | F | H | G | Q | K | L | N | N | V | N | L | K | Y | N | A | S | N | Q | T | F | T | A | T | Y | A | G | K | T | W | T | A | T | L | S | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | |||||
Sequence | L | G | L | S | P | T | D | S | Y | N | F | L | V | T | S | S | Q | Y | G | N | G | N | S | G | T | Y | A | S | G | V | M | R | A | D | L | D | G | A | T | L | T | Y | T | P | K | |||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | B | S | S | S | S | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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