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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4cbvE_ | PDB header: transcription | Chain: E: PDB Molecule: come; | PDBTitle: x-ray structure of full-length come from streptococcus pneumoniae. |
Added to library: Sat Feb 15 08:52:44 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | V | L | I | L | E | D | V | I | E | H | Q | V | R | L | E | R | I | L | D | E | I | S | K | E | S | N | I | P | I | S | Y | K | T | T | G | K | V | R | E | F | E | E | Y | I | E | N | D | E | V | N | Q | L | Y | F | L | A | I | D | I | H | G | I | E | K | K | G | F | E | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | S | S | S | S | B | T | T | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | Q | L | I | R | H | Y | N | P | Y | A | I | I | V | F | I | T | S | R | S | E | F | A | T | L | T | Y | K | Y | Q | V | S | A | L | D | F | V | D | K | D | I | N | D | E | X | F | K | K | R | I | E | Q | N | I | F | Y | T | K | S | X | L | L | E | N | E | D | V | V | D | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | G | G | T | G | G | G | G | T | S | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | F | D | Y | N | Y | K | G | N | D | L | K | I | P | Y | H | D | I | L | Y | I | E | T | T | G | V | S | H | K | L | R | I | I | G | K | N | F | A | K | E | F | Y | G | T | X | T | D | I | Q | E | K | D | K | H | T | Q | R | F | Y | S | P | H | K | S | F | L | V | N | I | G | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||
Sequence | I | R | E | I | D | R | K | N | L | E | I | V | F | Y | E | D | H | R | C | P | I | S | R | L | K | I | R | K | L | K | D | I | L | E | K | K | S | Q | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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