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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4c95C_ | PDB header: dna replication | Chain: C: PDB Molecule: dna polymerase alpha-binding protein; | PDBTitle: crystal structure of the carboxy-terminal domain of yeast2 ctf4 bound to sld5 |
Added to library: Sat May 3 08:11:27 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | F | R | Y | M | P | F | S | P | A | G | T | P | F | G | F | T | D | R | R | Y | L | T | M | N | E | V | G | Y | V | S | T | V | K | N | S | E | Q | Y | S | I | T | V | S | F | F | D | V | G | R | F | R | E | Y | H | F | E | D | L | F | G | Y | D | L | C | F | L | N | E | K | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | L | F | G | Q | S | K | T | G | Q | I | Q | Y | R | P | H | D | S | I | H | S | N | W | T | K | I | I | P | L | Q | A | G | E | R | I | T | S | V | A | A | T | P | V | R | V | I | V | G | T | S | L | G | Y | F | R | S | F | N | Q | F | G | V | P | F | A | V | E | K | T | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | P | I | V | A | L | T | A | Q | N | Y | R | V | F | S | V | H | Y | S | Q | F | H | G | L | S | Y | S | L | S | E | L | G | T | S | S | K | R | Y | Y | K | R | E | C | P | L | P | M | S | L | P | N | D | A | N | L | D | Y | Y | N | F | N | P | M | G | I | K | S | L | F | F | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | S | Y | G | D | P | C | I | F | G | S | D | N | T | L | L | L | L | S | K | W | R | S | P | E | E | S | K | W | L | P | I | L | D | S | N | M | E | I | W | K | M | S | G | G | K | E | T | T | D | I | H | V | W | P | L | A | L | A | Y | D | T | L | N | C | I | L | V | K | G | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | H | I | W | P | E | F | P | L | P | L | P | S | E | M | E | I | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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