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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4c3jG_ | PDB header: transcription | Chain: G: PDB Molecule: dna-directed rna polymerase i subunit rpa43; | PDBTitle: structure of 14-subunit rna polymerase i at 3.35 a resolution,2 crystal form c2-90 |
Added to library: Sat Oct 26 08:25:42 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | N | E | N | R | E | T | A | R | F | I | K | K | H | K | K | Q | V | T | N | P | I | D | E | K | N | G | T | S | N | C | I | V | R | V | P | I | A | L | Y | V | S | L | A | P | M | Y | L | E | N | P | L | Q | G | V | M | K | Q | H | L | N | P | L | V | M | K | Y | N | N | K | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | B | T | T | T | B | G | G | G | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | G | V | V | L | G | Y | E | G | L | K | I | L | D | A | D | P | L | D | T | S | E | K | L | I | K | I | T | P | D | T | P | F | G | F | T | W | C | H | V | N | L | Y | V | W | Q | P | Q | V | G | D | V | L | E | G | Y | I | F | I | Q | S | A | S | H | I | G | L | L | I | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | A | F | N | A | S | I | K | K | N | N | I | P | V | D | W | T | F | V | H | N | D | V | E | L | G | H | W | V | D | S | N | G | E | P | I | D | G | K | L | R | F | T | V | R | N | V | H | T | T | G | R | V | V | S | V | D | G | T | L | I | S | Y | N | S | S | R | S | Q | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | T | T | S | T | T | S | S | B | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | E | S | L | P | I | V | S | N | K | K | I | V | F | D | D | E | V | S | I | E | N | K | E | S | H | K | E | L | D | L | P | E | V | K | E | D | N | G | S | E | I | V | Y | E | E | N | T | S | E | |||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | B | T | T | S | B | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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