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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4c2m3_ | PDB header: transcription | Chain: 3: PDB Molecule: dna-directed rna polymerase i subunit rpa34; | PDBTitle: structure of rna polymerase i at 2.8 a resolution |
Added to library: Sat Oct 26 08:26:06 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | I | P | D | G | F | K | K | C | K | H | L | K | N | F | P | L | N | Q | Q | Q | V | W | L | I | K | F | P | S | N | V | D | I | S | K | L | K | S | L | P | V | S | T | T | M | T | I | D | K | H | D | Y | K | I | M | D | D | T | D | I | E | S | S | L | T | Q | D | N | L | S | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | T | T | S | T | T | T | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | M | T | L | L | V | P | S | E | S | K | E | S | L | K | I | A | S | T | A | K | D | N | A | P | L | Q | F | D | K | V | F | S | V | S | E | T | A | K | I | P | A | I | D | Y | S | K | V | R | V | P | R | K | D | V | P | K | V | E | G | L | K | L | E | H | F | A | T | G | Y | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | B | S | S | S | B | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | E | D | F | H | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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