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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4c0zK_ | PDB header: cell adhesion | Chain: K: PDB Molecule: ancillary protein 1; | PDBTitle: the n-terminal domain of the streptococcus pyogenes pilus2 tip adhesin cpa |
Added to library: Sat Nov 23 08:25:13 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | V | P | N | K | Q | S | S | V | Q | D | Y | P | W | Y | G | Y | D | S | Y | S | K | G | Y | P | D | Y | S | P | L | K | T | Y | H | N | L | K | V | N | L | D | G | S | K | E | Y | Q | A | Y | C | F | N | L | T | K | H | F | P | S | K | S | D | S | V | R | S | Q | W | Y | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T | S | S | T | T | S | T | T | S | B | B | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | L | E | G | T | N | E | N | F | I | K | L | A | D | K | P | R | I | E | D | G | Q | L | Q | Q | N | I | L | R | I | L | Y | N | G | Y | P | N | D | R | N | G | I | M | K | G | I | D | P | L | N | A | I | L | V | T | Q | N | A | I | W | Y | Y | T | D | S | S | Y | I | S | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . |
Sequence | T | S | K | A | F | Q | Q | E | E | T | D | L | K | L | D | S | Q | Q | L | Q | L | M | R | N | A | L | K | R | L | I | N | P | K | E | V | E | S | L | P | N | Q | V | P | A | N | Y | Q | L | S | I | F | Q | S | S | D | K | T | F | Q | N | L | L | S | A | E | Y | ||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | S | S | T | T | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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