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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4c0dC_ | PDB header: gene regulation | Chain: C: PDB Molecule: ccr4-not transcription complex subunit 3; | PDBTitle: structure of the not module of the human ccr4-not complex2 (cnot1-cnot2-cnot3) |
Added to library: Sat Oct 12 08:28:08 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | T | K | E | Q | L | Y | Q | Q | A | M | E | E | A | A | W | H | H | M | P | H | P | S | D | S | E | R | I | R | Q | Y | L | P | R | N | P | C | P | T | P | P | Y | H | H | Q | M | P | P | P | H | S | D | T | V | E | F | Y | Q | R | L | S | T | E | T | L | F | F | I | F | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | T | S | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | L | E | G | T | K | A | Q | Y | L | A | A | K | A | L | K | K | Q | S | W | R | F | H | T | K | Y | M | M | W | F | Q | R | H | E | E | P | K | T | I | T | D | E | F | E | Q | G | T | Y | I | Y | F | D | Y | E | K | W | G | Q | R | K | K | E | G | F | T | F | E | Y | R | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | G | G | G |   | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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