|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c4c0dB_ | PDB header: gene regulation | Chain: B: PDB Molecule: ccr4-not transcription complex subunit 2; | PDBTitle: structure of the not module of the human ccr4-not complex2 (cnot1-cnot2-cnot3) |
Added to library: Sat Oct 12 08:28:08 2013 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | M | V | T | D | Q | F | G | M | I | G | L | L | T | F | I | R | A | A | E | T | D | P | G | M | V | H | L | A | L | G | S | D | L | T | T | L | G | L | N | L | N | S | P | E | N | L | Y | P | K | F | A | S | P | W | A | S | S | P | C | R | P | Q | D | I | D | F | H | V | P | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | G | G | G | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G | T | T | S | S | G | G | G | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | Y | L | T | N | I | H | I | R | D | K | L | A | A | I | K | L | G | R | Y | G | E | D | L | L | F | Y | L | Y | Y | M | N | G | G | D | V | L | Q | L | L | A | A | V | E | L | F | N | R | D | W | R | Y | H | K | E | E | R | V | W | I | T | R | A | P | G | M | E | P | T | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | T | T | T | S | G | G | G | S | T | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . |
Sequence | K | T | N | T | Y | E | R | G | T | Y | Y | F | F | D | C | L | N | W | R | K | V | A | K | E | F | H | L | E | Y | D | K | L | E | E | R | P | H | L | P | S | T | F | N | Y | N | P | A | Q | Q | A | F | |||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | T | T | B | S | T | T | G | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|