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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4by6F_ | PDB header: transcription | Chain: F: PDB Molecule: general negative regulator of transcription subunit 5; | PDBTitle: yeast not1-not2-not5 complex |
Added to library: Sat Oct 19 08:22:26 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | N | A | A | F | Q | N | P | L | F | N | D | E | L | K | Y | W | L | D | S | K | R | Y | L | M | Q | P | L | Q | E | M | S | P | K | M | V | S | Q | L | E | S | S | L | L | N | C | P | D | S | L | D | A | D | S | P | C | L | Y | T | K | P | L | S | L | P | H | P | T | S | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | G | G | G | T | T | S | S | T | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | F | P | N | E | P | I | R | F | V | Y | P | K | K | D | D | D | I | Y | S | R | T | S | L | A | R | I | F | M | K | F | D | L | D | T | L | F | F | I | F | Y | H | Y | Q | G | S | Y | E | Q | F | L | A | A | R | E | L | F | K | N | R | N | W | L | F | N | K | V | D | R | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T | S | B | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||
Sequence | W | Y | Y | K | E | E | S | W | R | Y | F | D | Y | K | K | S | W | L | A | R | R | C | G | N | D | F | V | Y | N | E | E | D | F | E | K | L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | G | G | G | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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