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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4buhA_ | PDB header: immune system | Chain: A: PDB Molecule: clone m0418 scfv; | PDBTitle: human ige against the major allergen bet v 1 - crystal2 structure of clone m0418 scfv |
Added to library: Sat Nov 23 08:48:20 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | Q | L | V | Q | S | G | A | E | V | K | K | P | G | E | S | L | K | I | S | C | K | G | S | E | Y | S | F | P | N | Y | W | I | A | W | V | R | Q | M | P | G | K | G | L | E | W | M | G | M | I | Y | P | G | D | S | D | T | R | Y | S | P | S | F | Q | G | Q | V | N | I | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | G | G | G | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | B | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | D | K | S | S | R | T | A | F | L | E | W | S | S | L | K | A | S | D | S | A | T | Y | F | C | A | R | L | G | G | Q | L | W | N | S | Y | Y | Y | Y | Y | Y | M | D | V | W | G | K | G | T | T | V | T | V | S | S | G | Y | E | L | T | Q | P | P | S | A | S | G | T | P | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | S | S | G | G | G | T | T | S | S | S | B | B | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Q | R | V | T | I | S | C | S | G | S | S | S | N | I | G | G | N | T | V | N | W | Y | Q | Q | V | P | G | T | A | P | R | L | L | I | Y | K | N | N | Q | R | P | S | G | V | P | D | R | F | S | G | S | K | S | G | T | S | A | S | L | A | I | S | G | L | R | S | E | D | E | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | B | T | T | T | B | T | T | S | T | T | T | T | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||
Sequence | D | Y | Y | C | E | A | W | D | G | G | L | R | G | G | V | F | G | G | G | T | K | L | T | V | L | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | B | - |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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