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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4bsjA_ | PDB header: transferase | Chain: A: PDB Molecule: vascular endothelial growth factor receptor 3; | PDBTitle: crystal structure of vegfr-3 extracellular domains d4-5 |
Added to library: Sat Aug 3 08:57:42 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | H | N | P | F | I | S | V | E | W | L | K | G | P | I | L | E | A | T | A | G | D | E | L | V | K | L | P | V | K | L | A | A | Y | P | P | P | E | F | Q | W | Y | K | D | G | K | A | L | S | G | R | H | S | P | H | A | L | V | L | K | E | V | T | E | A | S | T | G | T | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | T | T | S | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | L | A | L | W | N | S | A | A | G | L | R | R | N | I | S | L | E | L | V | V | N | V | P | P | Q | I | H | E | K | E | A | S | S | P | S | I | Y | S | R | H | S | R | Q | A | L | T | C | T | A | Y | G | V | P | L | P | L | S | I | Q | W | H | W | R | P | W | T | P | C | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | G | G | G | G | S | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | M | F | P | Q | C | R | D | W | R | A | V | T | T | Q | D | A | V | N | P | I | E | S | L | D | T | W | T | E | F | V | E | G | K | N | K | T | V | S | K | L | V | I | Q | N | A | N | V | S | A | M | Y | K | C | V | V | S | N | K | V | G | Q | D | E | R | L | I | Y | F | Y | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | T | T | H | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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