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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4bn2A_ | PDB header: motor protein | Chain: A: PDB Molecule: kinesin-like protein kif15; | PDBTitle: kinesin |
Added to library: Sat Jan 18 08:32:13 2014 | |
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Sequence | G | D | A | I | K | V | F | V | R | I | R | P | P | A | E | R | S | Q | N | L | C | L | S | V | L | S | S | T | S | L | R | L | H | S | N | P | E | P | K | T | F | T | F | D | H | V | A | D | V | D | T | T | Q | E | S | V | F | A | T | V | A | K | S | I | V | E | S | C | M | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | Y | N | G | T | I | F | A | Y | G | Q | T | G | S | G | K | T | F | T | M | M | G | P | S | E | S | D | N | F | S | H | N | L | R | G | V | I | P | R | S | F | E | Y | L | F | S | L | I | D | R | E | K | G | K | S | F | L | C | K | C | S | F | I | E | I | Y | N | E | Q | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | S | S | T | S | S | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | D | L | L | D | S | A | S | A | G | L | Y | L | R | E | H | I | K | K | G | V | F | V | V | G | A | V | E | Q | V | V | T | S | A | A | E | A | Y | Q | V | L | S | G | G | W | R | N | R | R | V | A | S | T | S | M | N | R | E | S | S | R | S | H | A | V | F | T | I | T | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | - | T | T | T | T | S | T | S | S | T | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | E | S | M | E | K | S | N | E | I | V | N | I | R | T | S | L | L | N | L | V | D | L | A | G | S | E | R | N | I | N | R | S | L | S | C | L | G | Q | V | I | T | A | L | V | D | V | G | N | G | K | Q | R | H | V | C | Y | R | D | S | K | L | T | F | L | L | R | D | S | L | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | S | G | G | G | S | T | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | |||||
Sequence | G | N | A | K | T | A | I | I | A | N | V | H | P | G | S | R | C | F | G | E | T | L | S | T | L | N | F | A | Q | R | A | K | L | I | K | N | K | A | V | V | N | E | D | T | Q | G | ||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | G | G | G | T | T |
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