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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4blqB_ | PDB header: hydrolase | Chain: B: PDB Molecule: p4; | PDBTitle: p4 protein from bacteriophage phi8 |
Added to library: Sat Aug 24 08:28:35 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | N | S | I | I | D | L | G | P | R | V | Q | S | L | M | E | Q | L | A | T | T | K | L | E | E | G | V | K | N | L | D | M | G | S | V | Y | E | I | T | T | V | M | V | L | G | N | S | I | L | G | F | H | K | G | D | L | V | K | M | V | R | P | S | V | S | A | R | D | L | I | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | T | B | S | S | S | S | T | T | T | T | T | S | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | G | Y | A | T | A | S | A | A | V | V | R | Q | R | L | I | E | H | K | I | E | A | G | A | E | L | I | I | S | G | T | A | G | G | K | T | V | L | T | N | H | Y | A | A | Q | M | C | A | K | G | L | K | V | A | V | V | S | M | A | E | A | E | R | P | L | Y | G | S | V | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | T | T | T | B | S | S | T | T | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | H | V | F | A | A | L | H | L | A | A | V | S | D | V | D | V | L | Y | V | D | S | L | R | S | V | Y | N | E | L | G | G | N | L | K | G | V | S | R | Q | V | D | G | M | L | T | A | L | D | Q | Y | A | R | A | V | N | M | R | V | V | F | T | L | N | P | S | D | D | E | N | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | D | A | A | V | R | S | V | F | K | T | A | S | A | S | M | H | T | A | R | R | I | K | S | F | A | V | N | G | T | A | F | T | A | E | T | E | I | H | L | R | A | D | R | S | N | S | A | N | R | V | S | G | D | L | V | S | R | |||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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