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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4bkxA_ | PDB header: transcription | Chain: A: PDB Molecule: metastasis-associated protein mta1; | PDBTitle: the structure of hdac1 in complex with the dimeric elm2-sant domain2 of mta1 from the nurd complex |
Added to library: Sat Jul 6 08:25:17 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | E | I | R | V | G | N | R | Y | Q | A | D | I | T | D | L | L | K | E | G | E | E | D | G | R | D | Q | S | R | L | E | T | Q | V | W | E | A | H | N | P | L | T | D | K | Q | I | D | Q | F | L | V | V | A | R | S | V | G | T | F | A | R | A | L | D | S | L | H | M | S | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | T | T | S | T | T | T | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | A | A | S | R | D | I | T | L | F | H | A | M | D | T | L | H | K | N | I | Y | D | I | S | K | A | I | S | A | L | V | P | Q | G | G | P | V | L | C | R | D | E | M | E | E | W | S | A | S | E | A | N | L | F | E | E | A | L | E | K | Y | G | K | D | F | T | D | I | Q | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | D | F | L | P | W | K | S | L | T | S | I | I | E | Y | Y | Y | M | W | K | T | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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