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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4bk4B_ | PDB header: signaling protein | Chain: B: PDB Molecule: ephrin type-a receptor 4; | PDBTitle: crystal structure of the human epha4 ectodomain |
Added to library: Sat Jul 6 08:30:02 2013 | |
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Sequence | P | A | N | E | V | T | L | L | D | S | R | S | V | Q | G | E | L | G | W | I | A | S | P | L | E | G | G | W | E | E | V | S | I | M | D | E | K | N | T | P | I | R | T | Y | Q | V | C | N | V | M | E | P | S | Q | N | N | W | L | R | T | D | W | I | T | R | E | G | A | Q | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | B | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | Y | I | E | I | K | F | T | L | R | D | C | N | S | L | P | G | V | M | G | T | C | K | E | T | F | N | L | Y | Y | Y | E | S | D | N | D | K | E | R | F | I | R | E | N | Q | F | V | K | I | D | T | I | A | A | D | E | S | F | T | Q | V | D | I | G | D | R | I | M | K | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | T | E | I | R | D | V | G | P | L | S | K | K | G | F | Y | L | A | F | Q | D | V | G | A | C | I | A | L | V | S | V | R | V | F | Y | K | K | C | P | L | T | V | R | N | L | A | Q | F | P | D | T | I | T | G | A | D | T | S | S | L | V | E | V | R | G | S | C | V | N | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | B | S | S | S | S | S | S | B | B | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | S | E | E | K | D | V | P | K | M | Y | C | G | A | D | G | E | W | L | V | P | I | G | N | C | L | C | N | A | G | H | E | E | R | S | G | E | C | Q | A | C | K | I | G | Y | Y | K | A | L | S | T | D | A | T | C | A | K | C | P | P | H | S | Y | S | V | W | E | G | A | T | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | ||||||||||||||||||||||||||
Sequence | C | T | C | D | R | G | F | F | R | A | D | N | D | A | A | S | M | P | C | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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