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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4bjvA_ | PDB header: ligase | Chain: A: PDB Molecule: methionine--trna ligase, cytoplasmic; | PDBTitle: crystal structure of the aimp3-mrs n-terminal domain complex |
Added to library: Sat May 4 08:47:52 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | R | L | F | V | S | D | G | V | P | G | C | L | P | V | L | A | A | A | G | R | A | R | G | R | A | E | V | L | I | S | T | V | G | P | Q | D | C | V | V | P | F | L | T | R | P | K | V | P | V | L | Q | L | D | S | G | N | Y | L | F | S | T | S | A | I | C | R | Y | F | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | G | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | L | S | G | W | E | Q | D | D | L | T | N | Q | W | L | E | W | E | A | T | E | L | Q | P | A | L | S | A | A | L | Y | Y | L | V | V | Q | G | K | K | G | E | D | V | L | G | S | V | R | R | A | L | T | H | I | D | H | S | L | S | R | Q | N | C | P | F | L | A | G | E | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | S | L | A | D | I | V | L | W | G | A | L | Y | P | L | L | Q | D | P | A | Y | L | P | E | E | L | S | A | L | H | S | W | F | Q | T | L | S | T | Q | E | P | C | Q | R | A | A | Q | T | V | L | K | Q | Q | G | V | L | A | L | R | P | Y | L | Q | K | Q | P | Q | P | S | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | G | G | G | S | T | T | S | T | T | G | G | G | G | G | T | S |   | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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