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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4bjnC_ | PDB header: protein transport | Chain: C: PDB Molecule: avrm-a; | PDBTitle: crystal structure of the flax-rust effector avrm-a |
Added to library: Sat Oct 19 08:23:48 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | F | D | R | G | F | L | R | P | F | G | A | K | M | K | F | L | K | P | D | Q | V | Q | K | L | S | T | D | D | L | I | T | Y | M | A | E | K | D | K | N | V | R | D | L | A | I | K | L | R | D | A | K | Q | D | S | T | P | E | I | K | Q | T | Y | D | K | A | Y | E | K | T | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | A | A | E | K | L | V | S | E | E | S | L | T | R | D | A | L | L | K | L | T | E | E | Q | Y | V | E | K | A | A | L | F | D | K | D | V | Y | R | N | N | L | K | R | Q | T | Y | E | K | L | L | R | S | E | T | D | V | L | Y | R | E | V | A | R | I | F | I | A | R | E | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | T | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | P | A | L | T | A | K | I | E | R | L | A | L | T | L | P | I | D | Y | L | A | I | A | A | D | F | L | K | N | Q | A | N | L | H | A | D | D | P | E | L | N | L | Y | K | A | E | I | K | A | R | E | I | E | A | N | R | A | M | K | E | A | L | K | G | A | D | K | L | F | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S |   | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | R | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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