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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4bjiA_ | PDB header: dna binding protein | Chain: A: PDB Molecule: transcription factor tau subunit sfc1; | PDBTitle: sfc1-dbd |
Added to library: Sat Aug 3 08:26:21 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | R | V | W | I | I | T | T | N | X | G | V | E | S | V | P | T | C | R | H | S | K | L | G | E | P | S | K | T | I | Q | E | V | I | E | A | L | K | P | L | F | E | K | R | P | V | W | T | R | R | A | L | L | N | H | L | D | P | S | Y | T | H | Y | L | K | F | A | L | P | Y | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T | S | G | G | G | T | T | T | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | Y | L | W | T | S | G | P | F | R | D | T | Y | T | R | F | G | Y | D | P | R | K | D | S | N | A | A | A | Y | Q | A | L | F | F | K | L | K | G | T | K | T | H | V | F | D | G | K | T | L | F | P | T | N | R | V | Y | Q | V | C | D | I | V | D | P | T | I | A | P | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | G | G | G | G | G | G | B | B | S | S | S | B | G | G | G | B | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . |
Sequence | K | D | T | Q | L | R | S | E | C | H | R | D | T | G | W | Y | R | S | G | R | Y | Y | K | V | R | D | L | X | R | E | K | L | F | A | L | I | E | G | E | X | P | S | E | V | A | V | N | X | I | L | N | A | E | E | V | |||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | B | T | T | T | B | T | S | T | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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