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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4bgvB_ | PDB header: oxidoreductase | Chain: B: PDB Molecule: malate dehydrogenase; | PDBTitle: 1.8 a resolution structure of the malate dehydrogenase from2 picrophilus torridus in its apo form |
Added to library: Sat Apr 19 22:48:06 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | R | S | K | I | S | V | I | G | A | G | A | V | G | A | T | V | A | Q | T | L | A | I | R | Q | T | G | D | I | Y | I | F | D | I | V | D | G | L | A | E | G | K | A | L | D | I | L | E | G | A | P | H | W | G | Y | D | L | D | I | K | G | F | C | T | A | D | E | S | K | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S | G | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | E | M | K | G | S | D | V | I | V | V | T | A | G | L | A | R | K | P | G | M | S | R | D | D | L | L | L | K | N | I | G | I | M | K | S | V | G | E | A | I | K | K | Y | S | P | E | S | K | I | V | V | V | T | N | P | A | D | I | M | A | Y | A | I | Y | K | A | S | G | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | P | E | R | I | I | G | L | G | G | S | L | D | S | T | R | F | R | T | F | L | A | Q | E | L | N | V | S | F | E | D | V | N | A | F | V | I | G | G | H | G | D | D | M | V | P | F | I | R | Y | S | N | V | S | G | I | P | I | E | D | L | L | P | R | E | K | I | D | E | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | T | G | G | G | S | G | G | G | G | G | G | T | T | G | G | G | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | V | K | R | T | R | F | G | G | G | E | I | V | N | L | Y | K | T | G | S | A | F | Y | A | P | G | I | S | I | A | V | M | V | E | S | I | V | N | D | R | K | R | V | I | P | C | A | A | Y | I | T | G | E | H | S | K | T | Y | L | V | N | N | L | F | I | G | V | P | I | K | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | |||||||||||||||
Sequence | G | K | N | G | V | E | K | I | Y | D | L | K | F | N | E | D | E | L | E | A | W | K | K | S | V | E | S | V | K | K | N | S | A | I | A | D | D | Y | F | A | K | N | Q | |||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T |
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