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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4bgnB_ | PDB header: transport protein | Chain: B: PDB Molecule: voltage-gated sodium channel; | PDBTitle: cryo-em structure of the navct voltage-gated sodium channel |
Added to library: Sat Jul 13 08:30:11 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | R | F | T | S | A | I | I | V | L | I | V | I | N | A | I | V | V | G | M | E | T | Y | P | G | I | Y | Q | P | Y | Q | D | W | F | Y | L | I | D | R | M | I | L | W | V | F | T | A | E | I | I | L | K | L | V | A | T | R | P | R | Y | H | F | F | K | D | S | W | N | V | F | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | L | I | V | A | S | G | H | L | F | V | G | A | Q | F | V | T | V | L | R | V | L | R | V | L | R | L | L | R | A | V | T | V | I | P | S | L | G | N | I | M | L | L | M | G | L | I | F | Y | I | F | G | V | M | G | T | F | L | F | R | D | V | A | P | E | Y | F | G | S | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | G | G | G | G | G | G | S | S | T | T | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | H | L | S | L | I | T | L | F | Q | V | V | T | L | E | S | W | A | S | G | I | M | R | P | I | M | A | E | V | F | W | S | W | I | Y | F | V | A | F | I | L | V | G | T | F | V | I | F | N | L | F | V | G | V | I | V | S | N | V | E | R | A | E | T | E | D | A | E | Q | E | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | S | T | T |   | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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