|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c4be3A_ | PDB header: lyase | Chain: A: PDB Molecule: alginate lyase, family pl7; | PDBTitle: crystal structure of the exolytic pl7 alginate lyase alya52 from zobellia galactanivorans |
Added to library: Sat Jun 29 08:23:20 2013 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | T | K | Y | P | S | E | L | I | P | Q | M | D | E | W | K | I | L | L | G | D | G | T | H | K | E | D | L | V | N | Y | A | K | D | D | F | F | Y | V | E | H | E | N | E | T | D | W | V | V | F | K | T | P | N | S | G | I | T | S | R | T | S | S | N | T | R | T | E | L | G | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | G | G | G | T | T | S | S | T | T | B | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | K | H | W | I | P | E | T | G | G | K | L | N | A | T | L | K | V | Q | H | V | S | T | S | G | D | A | R | V | A | A | S | Y | S | V | V | V | G | Q | I | H | S | D | E | G | H | E | N | E | P | I | K | I | F | Y | K | K | F | P | G | H | T | K | G | S | V | F | W | N | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | T | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T | T | S | S | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | I | N | T | K | G | D | N | S | K | R | W | D | Y | S | T | A | V | W | G | Y | D | M | S | V | V | G | P | T | A | T | S | Y | P | E | E | P | E | D | G | I | A | L | G | E | E | F | S | Y | E | I | N | V | Y | E | G | I | M | Y | L | T | F | S | S | E | G | H | K | T | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | G | G | G | S | T | T | S | B | T | T | B | T | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | K | F | T | K | N | L | L | K | S | N | F | T | K | K | S | D | I | P | Q | Q | I | K | T | L | Y | A | S | I | G | R | D | G | I | E | R | E | N | A | Y | A | G | E | I | Q | Y | F | K | L | G | A | Y | N | Q | T | N | G | K | S | P | E | D | N | L | V | W | S | T | G | A | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | G | G | G | S | T | T | T | T | B | T | T | T | T | T | T | G | G | G | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | ||||||||||
Sequence | V | Y | D | G | D | I | A | K | Q | Y | A | N | G | S | Y | A | E | V | W | F | K | E | A | T | L | G | S | G | S | A | P | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|