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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4basA_ | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: adp-ribosylation factor, putative (small gtpase, | PDBTitle: structure of the arl6 bbs3 small gtpase from trypanosoma2 brucei with bound nucleotide analogue gppnp |
Added to library: Thu Jan 10 00:02:50 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | K | L | Q | V | V | M | C | G | L | D | N | S | G | K | T | T | I | I | N | Q | V | K | P | A | Q | H | I | T | A | T | V | G | Y | N | V | E | T | F | E | K | G | R | V | A | F | T | V | F | D | M | G | G | A | K | K | F | R | G | L | W | E | T | Y | Y | D | N | I | D | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | T | T | S | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | I | F | V | V | D | S | S | D | H | L | R | L | C | V | V | K | S | E | I | Q | A | M | L | K | H | E | D | I | R | R | E | L | P | G | G | G | R | V | P | F | L | F | F | A | N | K | M | D | A | A | G | A | K | T | A | A | E | L | V | E | I | L | D | L | T | T | L | M | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | T | S | S | B | T | T | S | B | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | |||||||||||||||||
Sequence | D | H | P | F | V | I | F | A | S | N | G | L | K | G | T | G | V | H | E | G | F | S | W | L | Q | E | T | A | S | R | Q | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | B | T | T | T | T | B | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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