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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4b9pA_ | PDB header: carbohydrate-binding protein | Chain: A: PDB Molecule: type 3a cellulose-binding domain protein; | PDBTitle: biomass sensoring module from putative rsgi2 protein of2 clostridium thermocellum resemble family 3 carbohydrate-3 binding module of cellulosome |
Added to library: Sat Sep 14 08:24:28 2013 | |
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Sequence | T | D | L | L | T | K | I | E | L | Q | A | Y | N | H | I | R | T | S | E | T | K | E | L | Q | P | R | I | K | L | I | N | T | G | N | T | P | I | T | L | S | E | V | K | I | R | Y | Y | Y | T | K | D | Q | V | I | N | E | I | Y | T | C | D | W | S | N | I | T | S | S | K | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | B | S | S | S | G | G | G | T | T | S | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | G | T | V | V | Q | M | S | N | P | K | P | N | A | D | S | Y | V | E | I | G | F | T | N | S | A | G | V | L | N | P | G | E | Y | V | E | I | I | S | R | I | G | N | S | Y | A | L | S | L | A | T | P | P | Y | S | E | W | N | Y | M | Y | D | Q | N | S | D | Y | S | F | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | G | G | G | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||
Sequence | N | S | S | S | D | F | V | V | W | D | K | I | T | V | Y | I | S | G | T | L | Y | W | G | I | E | P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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