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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4b93B_ | PDB header: exocytosis | Chain: B: PDB Molecule: ankyrin repeat domain-containing protein 27; | PDBTitle: complex of vamp7 cytoplasmic domain with 2nd ankyrin repeat2 domain of varp |
Added to library: Sat Nov 3 16:00:15 2012 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | D | Y | R | E | V | E | K | L | L | R | A | V | A | D | G | D | L | E | M | V | R | Y | L | L | E | W | T | S | G | L | G | V | N | V | T | S | Q | D | G | S | S | P | L | H | V | A | A | L | H | G | R | A | D | L | I | P | L | L | L | K | H | G | A | N | A | G | A | R | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | D | Q | A | V | P | L | H | L | A | C | Q | Q | G | H | F | Q | V | V | K | C | L | L | D | S | N | A | K | P | N | K | K | D | L | S | G | N | T | P | L | I | Y | A | C | S | G | G | H | H | E | L | V | A | L | L | L | Q | H | G | A | S | I | N | A | S | N | N | K | G | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | G | G | G | T | T | T | T | B | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . |
Sequence | T | A | L | H | E | A | V | I | E | K | H | V | F | V | V | E | L | L | L | L | H | G | A | S | V | Q | V | L | N | K | R | Q | R | T | A | V | D | C | A | E | Q | N | S | K | I | M | E | L | L | Q | V | |||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | T | T | S | T | T | S | S | G | G | G | S | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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