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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4b60B_ | PDB header: cell adhesion | Chain: B: PDB Molecule: fibronectin-binding protein a; | PDBTitle: structure of rfnbpa(189-505) in complex with fibrinogen2 gamma chain c-terminal peptide |
Added to library: Sat Oct 12 08:27:29 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | D | V | T | S | K | V | T | V | E | I | G | S | I | E | G | H | N | N | T | N | K | V | E | P | H | A | G | Q | R | A | V | L | K | Y | K | L | K | F | E | N | G | L | H | Q | G | D | Y | F | D | F | T | L | S | N | N | V | N | T | H | G | V | S | T | A | R | K | V | P | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | G | G | G | G | G | G | S | S | G | G | G | T | S | T | T | T | T | S | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | K | N | G | S | V | V | M | A | T | G | E | V | L | E | G | G | K | I | R | Y | T | F | T | N | D | I | E | D | K | V | D | V | T | A | E | L | E | I | N | L | F | I | D | P | K | T | V | Q | T | N | G | N | Q | T | I | T | S | T | L | N | E | E | Q | T | S | K | E | L | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | G | G | G | T | T | S | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | K | Y | K | D | G | I | G | N | Y | Y | A | N | L | N | G | S | I | E | T | F | N | K | A | N | N | R | F | S | H | V | A | F | I | K | P | N | N | G | K | T | T | S | V | T | V | T | G | T | L | M | K | G | S | N | Q | N | G | N | Q | P | K | V | R | I | F | E | Y | L | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | N | N | E | D | I | A | K | S | V | Y | A | N | T | T | D | T | S | K | F | K | E | V | T | S | N | M | N | L | N | L | Q | N | N | G | S | Y | S | L | N | I | E | N | L | D | K | T | Y | V | V | H | Y | D | G | E | Y | L | N | G | T | D | V | D | F | R | T | Q | M | V | G | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | T | T | T | T | T | T | T | G | G | G | T | T | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | P | Y | T | L | T | W | D | N | G | L | V | L | Y | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | - |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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