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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4ayjA_ | PDB header: transferase | Chain: A: PDB Molecule: bogt - metal-independent glycosyltransferase; | PDBTitle: molecular structure of a metal-independent bacterial2 glycosyltransferase that catalyzes the synthesis of histo-3 blood group a antigen |
Added to library: Wed Jan 9 19:31:27 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | R | I | G | I | L | Y | I | C | T | G | K | Y | D | I | F | W | K | D | F | Y | L | S | A | E | R | Y | F | M | Q | D | Q | S | F | I | I | E | Y | Y | V | F | T | D | S | P | K | L | Y | D | E | E | N | N | K | H | I | H | R | I | K | Q | K | N | L | G | W | P | D | N | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | B | T | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | K | R | F | H | I | F | L | R | I | K | E | Q | L | E | R | E | T | D | Y | L | F | F | F | N | A | N | L | L | F | T | S | P | I | G | K | E | I | L | P | P | S | D | S | N | G | L | L | G | T | M | H | P | G | F | Y | N | K | P | N | S | E | F | T | Y | E | R | R | D | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | S | T | T | S | B | G | G | G | S | S | S | S | T | T | T | T | T | S | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | T | A | Y | I | P | E | G | E | G | R | Y | Y | Y | A | G | G | L | S | G | G | C | T | K | A | Y | L | K | L | C | T | T | I | C | S | W | V | D | R | D | A | T | N | H | I | I | P | I | W | H | D | E | S | L | I | N | K | Y | F | L | D | N | P | P | A | I | T | L | S | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | S | S | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | Y | L | Y | P | E | G | W | L | L | P | F | E | P | I | I | L | I | R | D | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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